Стоимость медицинских услуг определяется лечебным учреждением исходя из перечня мероприятий, запланированных согласно медицинских показаний и пожеланий пациента. Существуют ориентировочные расценки для услуг, оказываемых немецкими лечебными учреждениями. Окончательная сумма зависит от уровня клиники (университетская или академическая), возраста и состояния здоровья пациента, наличия сопутствующих заболеваний, вероятности возникновения осложнений.

Медицинское учреждение перед началом лечения может выставить только предварительную калькуляцию стоимости медицинских услуг. Лечение производится при условии 100% предоплаты суммы, указанной в предварительной калькуляции. Оплата производится на банковский счёт клиники. После этого высылается документ, подтверждающий оплату и дату начала лечения. Этот документ является основанием для открытия Шенгенской визы в
посольстве Германии.

Если при проведении лечебных мероприятий конечная стоимость медицинских услуг окажется больше оплаченной авансовой суммы, то пациент обязан осуществить доплату. Это возможно сделать безналичным перечислением или наличным расчётом в кассу лечебного учреждения.

При ситуации, когда окончательная стоимость лечебных услуг оказывается ниже авансового платежа, пациент получит сумму разницы обратно перечислением на указанный банковский счёт. Исключением из этого правило являются клиники, находящиеся на территории федеральной земли Бавария. Они оставляют за собой право не возвращать остаток суммы пациенту.

Срок проведения окончательного расчёта с пациентом составляет, как правило, 3-4 недели после окончания лечения.